Très vaste zone humide résultant du comblement progressif des golfes de Machecoul et de Challans, le Marais breton (35 940 ha avec environ de 75 % en Vendée) constitué au niveau de la baie de Bourgneuf de vasières et de prés salés, est une zone quotidienne d’échange entre les apports d’eau douce (eau nourricière) chargée en sels minéraux et en matière organique venant du marais et l’eau salée bénéfique pour les marais salants (commune de la Barre-de-Monts). On trouve également une zone de polders à vocation à la fois agricole mais aussi ostréicole (à la suite des années 50) avec la lagune de Bouin.



Les marais salés, anciens marais salants avant 1950, conservent leur fonctionnement traditionnel (pâturage sur les bossis,…).

Sur la partie du marais doux, alimenté par les eaux douces (ruissellement et eaux de pluie) et qui a pris la place des marais salants, on retrouve des prairies entourées de fossés qui permettent l’évacuation des inondations fréquentes et bénéfiques pour la biodiversité.

La plage et les dunes viennent complétées cette mosaïque de milieux extrêmement intéressante du point de vue faunistique et floristique. En effet, on y trouve une végétation d’une remarquable diversité avec toutes les transitions des parties en permanence en eau à celles immergées par alternance, des zones salées aux zones douces, des sols argileux aux sols sableux ou tourbeux.